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武漢快速逆轉(zhuǎn)錄混合

來源: 發(fā)布時間:2023-11-04

RNA逆轉(zhuǎn)錄實驗注意事項:防止RNA模板的降解:毫無疑問,RNA質(zhì)量對cDNA合成結(jié)果會產(chǎn)生重要影響。但RNA很脆弱,易于降解。為了保證RNA的完整性,我們需要小心又小心,比如在冰上操作,用RNase-free的頭頭和離心管,減少操作時間等。在反應(yīng)體系中加入RNase抑制劑也能有效防止RNA降解。另外,建議在進行逆轉(zhuǎn)錄前,通過瓊脂糖凝膠電泳檢查RNA條帶的質(zhì)量。通常完整的真核RNA應(yīng)包括28S、18S條帶,且28S條帶強度一般是18S的兩倍左右。RNA逆轉(zhuǎn)錄實驗注意事項:選擇合適的引物:OligodT引物和隨機引物都能進行逆轉(zhuǎn)錄。OligodT引物只能與mRNA的3’端poly(A)結(jié)合,沒有rRNA和tRNA的干擾,特異性強。逆轉(zhuǎn)錄實驗中的RNA樣品處理時要避免使用酸性物質(zhì)、有機溶劑和酶切酶劑。武漢快速逆轉(zhuǎn)錄混合

逆轉(zhuǎn)錄的轉(zhuǎn)錄過程:基因的轉(zhuǎn)錄是由RNA聚合酶催化進行的。基因的上游具有結(jié)合RNA聚合酶的區(qū)域,叫作啟動子。啟動子是一段具有特定序列的DNA,具有和RNA聚合酶特異性結(jié)合的位點,決定了基因轉(zhuǎn)錄的起始位點。RNA聚合酶與啟動子結(jié)合后,在特定區(qū)域?qū)NA雙螺旋兩條鏈之間的氫鍵斷開,使DNA解旋,形成單鏈區(qū),以非編碼鏈為模板合成RNA互補鏈的過程就開始了。轉(zhuǎn)錄的延長是以前面核苷酸的3′-OH為基礎(chǔ)逐個加入NTP,形成磷酸二酯鍵,使RNA逐步從5′向3′端延伸的過程。在原核生物中,因為沒有核膜的分隔,轉(zhuǎn)錄未完成即已開始翻譯,而且在同一個DNA模板上同時進行多個轉(zhuǎn)錄過程。電鏡下看到的羽毛狀圖形和羽毛上的小黑點(多聚核糖體),是轉(zhuǎn)錄和翻譯高效率的直觀表現(xiàn)。武漢快速逆轉(zhuǎn)錄混合逆轉(zhuǎn)錄實驗前要對反應(yīng)體系進行無RNA和無反轉(zhuǎn)錄酶的對照。

反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項,在進行RT反應(yīng)之前,應(yīng)考慮以下幾個方面:RNA:成功的cDNA合成來自高質(zhì)量的RNA,高質(zhì)量的RNA至少應(yīng)保證全長并且不含逆轉(zhuǎn)錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。在提取RNA的過程中,要特別防止RNase的污染,同時在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中經(jīng)常加入RNase抑制劑以增加cDNA合成的長度和產(chǎn)量。RNase抑制劑要在首先鏈cDNA合成反應(yīng)中,在緩沖液和還原劑(如DTT)存在的條件下加入,因為cDNA合成前的過程會使抑制劑變性,從而釋放結(jié)合的可以降解RNA的RNase。蛋白RNase抑制劑只防止RNaseA,B,C對RNA的降解,并不能防止皮膚上的RNase,因此盡管使用了這些抑制劑,也要小心不要從手指上引入RNase,實驗過程中經(jīng)常更換新手套。

逆轉(zhuǎn)錄酶(M-MLV)從MoloneyMurineLeukemiaVirus分離出來,可用于合成首先鏈cDNA、制作cDNA探針、RNA轉(zhuǎn)錄、測序和RNA的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。本酶是通過點突變使RNaseH活性缺失,所以它具有的DNA聚合酶的活性與野生型相同,同時其延伸能力也有明顯提高。逆轉(zhuǎn)錄酶(M-MLV)一個活性單位定義為在37℃,10min條件下,使1nmol的脫氧核糖核酸摻入酸性沉淀物質(zhì)所需的酶量。逆轉(zhuǎn)錄酶的三個功能:1、RNA為模板指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;2、DNA為模板指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;3、RNaseh活性。逆轉(zhuǎn)錄過程的揭示是分子生物學(xué)研究中的重大發(fā)現(xiàn),是對中心法則的重要修正和補充。

逆轉(zhuǎn)錄過程是病毒的復(fù)制形式之一,如RNA病毒中的逆轉(zhuǎn)錄病毒,DNA病毒中的擬逆轉(zhuǎn)錄病毒的復(fù)制均需要經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄。逆轉(zhuǎn)錄過程在真核細胞中也同樣存在,例如逆轉(zhuǎn)座子和端粒DNA的延長均存在逆轉(zhuǎn)錄過程,需逆轉(zhuǎn)錄酶的催化,端粒酶即為真核細胞中的逆轉(zhuǎn)錄酶。逆轉(zhuǎn)錄過程的揭示是分子生物學(xué)研究中的重大發(fā)現(xiàn),是對中心法則的重要修正和補充。人們通過體外模擬該過程,以樣本中提取的mRNA為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補的cDNA,構(gòu)建cDNA文庫,并從中篩選特異的目的基因。該方法已成為基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的策略之一。逆轉(zhuǎn)錄實驗可以選擇加入RNA合成抑制劑RNAse防止RNA降解和污染。武漢快速逆轉(zhuǎn)錄混合

逆轉(zhuǎn)錄過程是病毒的復(fù)制形式之一,如RNA病毒中的逆轉(zhuǎn)錄病毒。武漢快速逆轉(zhuǎn)錄混合

RNA逆轉(zhuǎn)錄實驗注意事項:去除基因組DNA污染:殘留的基因組DNA(gDNA)會對熒光定量結(jié)果造成很大的干擾,為了使結(jié)果更加的真實、可重復(fù),我們需要去除gDNA干擾。我們可以在引物設(shè)計時避免gDNA的擴增,比如將上下游引物分別設(shè)在不同的外顯子上;或者在提取RNA后使用DNaseI處理以除去gDNA。較后,我們還有非常法寶,選擇一款具有g(shù)DNA去除功能的逆轉(zhuǎn)錄試劑盒,一步到位去除gDNA,省心省力max。RNA逆轉(zhuǎn)錄實驗注意事項:逆轉(zhuǎn)錄酶熱穩(wěn)定性:逆轉(zhuǎn)錄酶在整個反轉(zhuǎn)錄體系中具有關(guān)鍵性影響。除了活性以外,逆轉(zhuǎn)錄酶的熱穩(wěn)定性同樣很重要,在較高溫度下進行逆轉(zhuǎn)錄,能夠減少RNA的二級結(jié)構(gòu),增加逆轉(zhuǎn)錄的效率。野生型的M-MLV逆轉(zhuǎn)錄酶很“怕熱”,高于37℃時,穩(wěn)定性大幅下降。武漢快速逆轉(zhuǎn)錄混合